R(二): http与R脚本通讯环境安装

结合实际的工作环境，在开始R研究的时候，首先着手收集的就是能以Web方式发布R运行结果的基础框架，无耐的是，R一直以来常使用于个人电脑的客户端程序上，大家习惯性的下载R安装包，在自己的电脑上安装 --> 写算法 --> 运行 --> 以贴图或者文档的形式发表自己的作品。花了较长时间，终于找着了一套框架基本满足要求，即FastRWeb (Fast Interactive Web Framework for Data Mining Using R），参考（http://www.rforge.net/FastRWeb/），FastRWeb 是一个基础架构环境, 可以让R脚本运行在任何WebServer上，展示数据和图形，用户通过URL地址与R脚本进行通信交互。

运行架构原理
R3.2.5 安装（centos7）
RStudio安装配置（centos7）
FastRWeb安装配置（centos7）
开发demo: hello world

运行架构原理：

注意：

Centos7 R3.2.5软件包安装:

centos 系统软件包下载地址（https://cran.r-project.org/src/base/R-3/）, 截止当前，最新版本3.3.1, 我们选择安装的版本为：3.2.5

安装R软件依赖程序包，命令清单如下：

yum install -y gcc

yum install -y gcc-c++

yum install -y gcc-gfortran

yum install -y readline-devel

yum install -y libXt-devel

yum install –y libcur*

yum install –y libxml*

yum install –y openssl*

将下载到本机的R安装包软件上传文件至linux主机的某目录下, 执行解压命令：tar -zxvf R-3.2.5.tar.gz

命令：cd R-3.2.5 (切换至解压后的目录)
命令：mkdir -p /home/work/R
命令：./configure --prefix=/home/work/R --enable-R-shlib （设置R的工作目录）
完成配置后界面如下显示，则OK

R is now configured for x86_64-pc-linux-gnu

  Source directory:          .

  Installation directory:    /home/work/R

  C compiler:                gcc -std=gnu99  -g -O2

  Fortran  compiler:       gfortran  -g -O2

  C++ compiler:              g++  -g -O2

  C++  compiler:           g++  -std=c++ -g -O2

  Fortran / compiler:    gfortran -g -O2

  Obj-C compiler:          

  Interfaces supported:      X11

  External libraries:        readline

  Additional capabilities:   NLS

  Options enabled:           shared R library, shared BLAS, R profiling

  Capabilities skipped:      PNG, JPEG, TIFF, cairo, ICU

  Options not enabled:       memory profiling

  Recommended packages:      yes

configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions of the R manuals

configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R manuals

configure: WARNING: you cannot build PDF versions of vignettes and help pages

[root@R R-3.2.]#

开始编译安装
命令：make
命令：make install
命令：vim ~/.bash_profile （配置环境变量，在打开的文件中加入下面一行代码，此处的R路径为上面安装时的–prefix=/home/work/R）

PATH=/home/work/R/bin:$PATH

命令：source ~/.bash_profile （使修改生效）
完成操作后执行： R （能正常进入R命令行，则ok,如下图 )

RStudio 安装配置：

RStudio是一个非常实用的R语言的IDE，其服务器端软件，可以将其构建在Linux服务器上，然后通过远程网页登陆访问，使得R语言的使用获得了极大的方便，也看成是一个小小的云服务，官网（https://www.rstudio.com/home/），如下图：RStudio Server 提供免费和商业授权版本

下载Centos 系统对应的软件安装包（rstudio-server-rhel-0.99.903-x86_64.rpm），上传至主机
命令： yum install --nogpgcheck rstudio-server-rhel-0.99.903-x86_64.rpm (软件安装）
命令： echo 'rsession-which-r=/home/work/R/bin/R' >> /etc/rstudio/rserver.conf （结合上下文看此参数配置）
RStudio 服务相关参考命令清单如下（仅作参考资料，在此步不用执行）：

systemctl status rstudio-server

systemctl start rstudio-server

systemctl stop rstudio-server

systemctl restart rstudio-server

执行下面的命令清单，给RStudio添加操作用户和权限

adduser rstudio

passwd rstudio

usermod -g rstudio-server rstudio

命令：systemctl start rstudio-server (启动rstudio-server 服务，默认监听端口 8787）

如果一切OK，通过浏览器就可以正常访问，如下：

FastRWeb安装：

FastRWeb 可以快速地构建一个R的Web环境，FastRWeb 底层依赖于CGI程序，也就是说，只要能支持CGI程序的WebServer，就可以运行FastRWeb
命令: yum install -y cairo-devel (安装FastRWeb依赖包Cairo)
命令：R （进入R命令行，FastRWeb 和 Rserve 安装包都是在R命令行下在线安装）

R命令： install.packages("FastRWeb") (此过程中选择安装镜像，centos7环境，选择 22 http mirrors, http cran mirrors 选择 21 (中国厦门））
安装成功后如下图：

g++ Rconnection.o Rcgi.o -o Rcgi -lcrypt

make[]: Leaving directory `/tmp/RtmpdpC13f/R.INSTALL53b568210efe/FastRWeb/src/Rcgi'

rm -rf ../inst/Rcgi

cp -r Rcgi ../inst

mkdir ../inst/cgi-bin

touch null.so null.dll # to make R CMD SHLIB happy

installing to /home/work/R/lib64/R/library/FastRWeb/libs

** R

** inst

** preparing package for lazy loading

** help

*** installing help indices

** building package indices

** testing if installed package can be loaded

* DONE (FastRWeb)

The downloaded source packages are in

    ‘/tmp/RtmpkNJBem/downloaded_packages’

Updating HTML index of packages in '.Library'

Making 'packages.html' ... done

>

R命令：install.packages("Rserve")

安装成功后界面如下图：

./mergefat Rserve "/home/work/R/lib64/R/bin/Rserve"

./mergefat Rserve.dbg "/home/work/R/lib64/R/bin/Rserve.dbg"

installing via 'install.libs.R' to /home/work/R/lib64/R/library/Rserve

** R

** inst

** preparing package for lazy loading

** help

*** installing help indices

** building package indices

** testing if installed package can be loaded

* DONE (Rserve)

The downloaded source packages are in

    ‘/tmp/RtmpkNJBem/downloaded_packages’

Updating HTML index of packages in '.Library'

Making 'packages.html' ... done

>

R命令： q() (退出R命令行，返回linux命令行）

创建FastRWeb基于Rserve的运行环境（切换至FastRWeb安装目录，　先查一下安装的目录，然后切换至该目录）
命令： find / -name FastRWeb (查 FastRWeb 安装目录，如下图）

命令：cd /home/work/R/lib64/R/library/FastRWeb     (切换至安装目录）
命令：./install.sh   （安装基于Rserve的运行环境，生成 /var/FastRWeb 目录）
命令：cd /var/FastRWeb/code
命令：ls -la    (查看文件内容）

rserve.conf:

rserve.R:

start:

命令：vim rserve.conf （默认情况下，rserve是提供socket通信接口，我们要将它改成http的通信接口，代码如下）

http.port 8888

remote enable

source /var/FastRWeb/code/rserve.R

control enable

修改文件：rserve.R, 在文件上的最上面增加2行代码，如下

library(FastRWeb)

.http.request <- FastRWeb:::.http.request

命令： ./start （开启服务，注意：必须切换至 /var/FastRWeb/code 目录下执行）

可通过 ps -aux|grep Rserve 和 netstat -nltp|grep Rserve 查看服务状态，如图：

要停止服务，可通过 kill 进程，如上图的进程号，执行命令： kill -9 53652
也可用如下命令

[root@hdpjn06 bin]# pwd

/home/work/R/bin

[root@hdpjn06 bin]# ll

total 36

-rwxr-xr-x 1 root root  8790 Mar  2 08:35 R

-rwxr-xr-x 1 root root 22540 Mar  2 08:35 Rscript

[root@hdpjn06 bin]# ./R CMD Rserve --RS-conf /var/FastRWeb/code/rserve.conf --vanilla --no-save

安装完成后，通过浏览器能正常访问则OK，默认监听端口 8888 （http://192.168.0.103:8888/info), 如下图

开发Demo: hello world

在Rstudio IDE 编写如下代码保存，命名为Demo.R, 你可以使用本地Windows环境下的 rstudio ide ,也可使用浏览器上的IDE 环境

run <- function(...){

  oprint("hello world")

  done()

}

如果是本地环境开发的，将保存的Demo.R 文件上传至 /var/FastRWeb/web.R 目录下

在浏览器执行： http://192.168.0.103:8888/Demo, 结果如下图则OK

R(二): http与R脚本通讯环境安装

R(二): http与R脚本通讯环境安装的相关教程结束。

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